CERTA gennemfører løbende strategiske analyse- og udviklingsprojekter af samfundsmæssig betydning. Det drejer sig bl.a. om følgende projekter:
Radikalisering og voldelig ekstremisme (TrygFonden)
Industrispionage (Industriens Fond)
Cyber-sikkerhed (Industriens Fond)
Vold, trusler og krænkelser på arbejdspladsen (Velliv Foreningen)